オートクレーブでは、装置内に高温の水蒸気を充満させて加熱滅菌するため、投入物に水分が直接付着します。
一方、ERSでは、装置の筐体層を高温の水蒸気で加熱することにより、装置内部の投入物を間接的に加熱滅菌します。投入物を水蒸気で濡らさないため、処理後の搬出物が再感染するリスクを低減できます。